对甲烷氧化菌的分类有很多困难,第一,这群菌很特殊,一般菌很少能生长在甲烷上,所以它们不可能归入已经描述和分类过的细菌可属中。第二,按传统分类法,它们很少有特征用于分类上;第三,很多甲烷氧化菌分离的目的是为了研究其代谢和应用,原始描述很难与分类特征相关联。 伯吉细菌鉴定手册第八版将这菌归为一个科甲基单孢菌科(Methylococcaceae)。但Whittenbury和Krieg认为该科的定义不够严格,它允许包括非甲烷氧化菌,即能生长在其他C1化合物(如甲醇、甲酸盐CO和胺)上的菌。因此它们在伯吉系统细菌学手册第一版(1984)中定了一个新科——甲基球菌科(Methylococcaceae)以取代甲基单孢菌科。它们认为目前对这些菌分类和命名混乱,主要由于缺乏公认的有效测定和分类指南,它们暂时将这些菌分为群和亚群(见表8-3),希望以后进一步能分属和种。
该科收入了两个属,一个模式属—甲基球菌属(Methylococcaceae),它的模式种是荚膜甲基球菌(M.capsulatus)对Romanovs Koaya等描述的9个种认为很不确切。另一属为甲基单细胞菌属。模式种是甲烷甲基单孢菌(Methylococcaceae)。已描述过其他5个种,也认为不很确切。此外,尚有四个属Methylobacillus、Methylobacterium、Methylosinus及Methylovibrio,为肯定其他分类地位。 此外,生丝微菌是一个特殊的兼性甲营养菌,该菌G-,有柄、鞭毛运动。出芽生殖。大多数菌很好生长在甲醇,仅生长在C1化合物和那些独特的靠乙酰COA途径代谢的物质上,这些物质如乙酸、醇和3-羟基丁酸,它们不生长在三碳或多碳原子的化合物上,它们常积累聚β–羟基丁酸作碳能贮藏物。 这菌的一个重要生理特征是能厌氧生长在甲醇上,用NO3-作电子受体。 它的形态也很特殊,一般长杆状,在一端或两端有柄,柄丝可分枝。分裂时,一个芽或子细胞在柄端形成,逐渐长大,有三根以上鞭毛着生在极附近,积极运动一段时期后,子细胞离去,活跃游动,最后失去鞭毛,形成一个柄丝,进而成为一个母细胞。
母细胞有时聚集一起成为一朵玫瑰花,柄朝外,细胞有内膜系统,富含脂肪酸(50-60%),均为C18的不饱和脂肪酸。
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