分类和优势属

长期以来，放线菌的分类是以形态特征作为标准。最近的分类趋势，除仍以形态和培养性状为主要分类标准外，其它性状如化学组分，核酸杂交，碱基比例，辐射光线反应等亦将作为鉴定和分类的标准。例如根据细胞壁的化学组成，可将放线菌分为4个型。

采用这类性状，有助于放线菌的分类与菌种鉴定，可提供一些补充的特征，它不会改变以形态特征为主的分类结果。

有关放线菌的分类系统较多，各家的观点不同，对于分类系统中科，属的排列方法也不一致。按中国科学院微生物研究所拟定的分类系统，放线菌目下分6科：