甲基营养菌能以还原C1化合物作唯一的碳源和能源。因此,在某种程度上说“甲基营养”这词不确切,它们能利用某些C1化合物并不包含甲基基团,如CO、甲酸盐等。它们对C1化合物的代谢分同化和异化两方面,图8-4展示它们的代谢途径。 绝对甲基营养菌能还原C1化合物外;不能利用任何其他物质生长。它们和异样甲基营养菌异样,生长在C1化合物上通过单磷酸核酮糖途径又名已酮糖磷酸途径和丝氨酸途径(因产丝氨酸故名)合成细胞物质。在甲醛氧化水平时将其全部或部分C结合为细胞C。单磷酸核酮糖途径比丝氨酸途径耗能少得多。大多数绝对甲基营养菌用此途径。丝氨酸途径合成的细胞C30~50%来自CO2,其余来自甲醛。自养甲基营养氧化生长基质为CO,以取得能量,并走Calvin循环途径同化细胞碳。
好氧甲基营养菌完全从氧化生长基质成CO2以获得能量,很多情况下这一氧化途径不包括三羟酸循环。有些菌的产能途径是经过直线方程: CH4→CH3OH→HCHO→HCOOH→CO2和(CH3)nN→HCHO而另一些菌是通过异化已糖磷酸途径:HCHO+C5→C6→C5+CO2
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